Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
OTOP1Q7RTM1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP1Q7RTM1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms