Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
H2AFVQ71UI9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
H2AFVQ71UI9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms