Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINGO4Q6UY18 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINGO4Q6UY18 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms