Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM220Q6QAJ8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms