Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO42Q6P3S6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO42Q6P3S6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms