Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1X6

C8orf82, UPF0598 protein C8orf82, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf82Q6P1X6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf82Q6P1X6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C8orf82Q6P1X6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms