Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PPP1R18Q6NYC8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPP1R18Q6NYC8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPP1R18Q6NYC8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms