Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCN10Q6JVE6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCN10Q6JVE6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCN10Q6JVE6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCN10Q6JVE6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCN10Q6JVE6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LCN10Q6JVE6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LCN10Q6JVE6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LCN10Q6JVE6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms