Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LEMD1Q68G75 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LEMD1Q68G75 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms