Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CARMIL1Q5VZK9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
CARMIL1Q5VZK9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CARMIL1Q5VZK9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CARMIL1Q5VZK9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms