Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YOD1Q5VVQ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
YOD1Q5VVQ6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YOD1Q5VVQ6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YOD1Q5VVQ6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YOD1Q5VVQ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YOD1Q5VVQ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YOD1Q5VVQ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YOD1Q5VVQ6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YOD1Q5VVQ6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YOD1Q5VVQ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YOD1Q5VVQ6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms