Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRCH2Q5VUJ6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRCH2Q5VUJ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRCH2Q5VUJ6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms