Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFMBT2Q5VUG0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SFMBT2Q5VUG0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SFMBT2Q5VUG0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms