Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR78Q5VTH9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR78Q5VTH9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms