Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RNF220Q5VTB9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF220Q5VTB9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms