Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FRMPD1Q5SYB0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FRMPD1Q5SYB0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC35■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
FRMPD1Q5SYB0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms