Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
CEP170Q5SW79 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
CEP170Q5SW79 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
CEP170Q5SW79 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms