Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGT7

RTP2, Receptor-transporting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP2Q5QGT7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTP2Q5QGT7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTP2Q5QGT7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP2Q5QGT7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 502.3 ms