Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3BQ502W6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA3BQ502W6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3BQ502W6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3BQ502W6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3BQ502W6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3BQ502W6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3BQ502W6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3BQ502W6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA3BQ502W6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms