Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYTL3Q4VX76 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYTL3Q4VX76 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms