Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTXN3Q4LDR2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTXN3Q4LDR2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTXN3Q4LDR2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms