Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CERKLQ49MI3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CERKLQ49MI3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CERKLQ49MI3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms