Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBS9Q3SYG4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS9Q3SYG4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS9Q3SYG4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms