Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT71Q3SY84 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms