Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM12Q3MHD2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM12Q3MHD2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms