Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP41Q3LFD5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP41Q3LFD5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms