Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC96Q2M329 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC96Q2M329 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms