Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ISXQ2M1V0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ISXQ2M1V0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ISXQ2M1V0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms