Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFX7Q2KHR2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RFX7Q2KHR2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX7Q2KHR2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms