Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN1Q16799 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RTN1Q16799 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTN1Q16799 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
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