Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP2B3Q16720 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B3Q16720 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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