Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F4Q16254 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
E2F4Q16254 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F4Q16254 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms