Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC85BQ15834 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
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