Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIP11Q15643 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIP11Q15643 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIP11Q15643 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms