Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYTH1Q15438 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYTH1Q15438 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms