Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDCD1Q15116 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDCD1Q15116 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDCD1Q15116 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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