Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SHPRHQ149N8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHPRHQ149N8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
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