Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSPNQ14714 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSPNQ14714 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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