Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CDK13Q14004 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CDK13Q14004 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CDK13Q14004 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
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