Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2H3Q13889 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H3Q13889 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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