Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IRF5Q13568 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRF5Q13568 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
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