Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCIRG1Q13488 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCIRG1Q13488 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCIRG1Q13488 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
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