Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3B2Q13367 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AP3B2Q13367 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
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