Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CBX3Q13185 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBX3Q13185 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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