Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF2Q12933 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF2Q12933 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF2Q12933 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms