Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFCP2Q12800 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFCP2Q12800 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFCP2Q12800 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
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