Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAGPQ0VAQ4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms