Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF543Q08ER8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF543Q08ER8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF543Q08ER8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms