Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHRNDQ07001 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHRNDQ07001 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms