Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 ARG1YOL058W 1263 nt4.55□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 APJ1YNL077W 1587 nt4.54□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 FZO1YBR179C 2568 nt4.54□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 SKG3YLR187W 3081 nt4.54□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 YDL119CYDL119C 924 nt4.54□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 EGD2YHR193C 525 nt4.54□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 MRP17YKL003C 396 nt4.54□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.54□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 YPL102CYPL102C 303 nt4.54□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 CLA4YNL298W 2529 nt4.54□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 DOA1YKL213C 2148 nt4.54□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.53□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 PCA1YBR295W 3651 nt4.53□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 YMR102CYMR102C 2505 nt4.53□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 MPP10YJR002W 1782 nt4.53□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 FAP1YNL023C 2898 nt4.53□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 YAP1YML007W 1953 nt4.53□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 PAP1YKR002W 1707 nt4.53□□□□□ -1.68
NEJ1Q06148 FRS1YLR060W 1788 nt4.53□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 BOP2YLR267W 1713 nt4.52□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 SCM3YDL139C 672 nt4.52□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 COG1YGL223C 1254 nt4.52□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 YGR153WYGR153W 654 nt4.52□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 SNN1YNL086W 309 nt4.52□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 CDC21YOR074C 915 nt4.52□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.52□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 VPS72YDR485C 2388 nt4.51□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 RAD16YBR114W 2373 nt4.51□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 NUP116YMR047C 3342 nt4.51□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 SDA1YGR245C 2304 nt4.51□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 VID22YLR373C 2706 nt4.51□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 RPL12AYEL054C 498 nt4.51□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 YGR016WYGR016W 573 nt4.51□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.51□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 RMA1YKL132C 1293 nt4.51□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 CPR6YLR216C 1116 nt4.51□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 GSP2YOR185C 663 nt4.51□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 MAK3YPR051W 531 nt4.51□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 HXT7YDR342C 1713 nt4.51□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 HXT6YDR343C 1713 nt4.51□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 FRE1YLR214W 2061 nt4.5□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 YJR124CYJR124C 1347 nt4.5□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 SEG2YKL105C 3399 nt4.5□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 RPS16BYDL083C 432 nt4.5□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 MNN11YJL183W 1269 nt4.5□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 CSR1YLR380W 1227 nt4.5□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 NHP6AYPR052C 282 nt4.5□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 ELP3YPL086C 1674 nt4.5□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 MSE1YOL033W 1611 nt4.5□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 EUG1YDR518W 1554 nt4.49□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 POM33YLL023C 840 nt4.49□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 YIM1YMR152W 1098 nt4.49□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 TRM10YOL093W 882 nt4.49□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 KRS1YDR037W 1776 nt4.49□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 KAR2YJL034W 2049 nt4.49□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 SAP155YFR040W 3009 nt4.49□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 UGA2YBR006W 1494 nt4.49□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 ABF1YKL112W 2196 nt4.48□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 MTF2YDL044C 1323 nt4.48□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 TFB3YDR460W 966 nt4.48□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 ERP5YHR110W 639 nt4.48□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 MMT2YPL224C 1455 nt4.48□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 MOT2YER068W 1764 nt4.48□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 KAP114YGL241W 3015 nt4.47□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 NSG1YHR133C 876 nt4.47□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 SEC13YLR208W 894 nt4.47□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 SSP120YLR250W 705 nt4.47□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 YML131WYML131W 1098 nt4.47□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 YTH1YPR107C 627 nt4.47□□□□□ -1.69
NEJ1Q06148 RVB1YDR190C 1392 nt4.46□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt4.46□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 GPP1YIL053W 753 nt4.46□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 YJL215CYJL215C 360 nt4.46□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 PDR15YDR406W 4590 nt4.46□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 YTA12YMR089C 2478 nt4.46□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 YDL172CYDL172C 480 nt4.45□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 SUR2YDR297W 1050 nt4.45□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 AVO2YMR068W 1281 nt4.45□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 HXT4YHR092C 1731 nt4.45□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 KDX1YKL161C 1302 nt4.45□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 TSL1YML100W 3297 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 RPL34AYER056C-A 366 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 SUT1YGL162W 900 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 SYF2YGR129W 648 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 FMP33YJL161W 543 nt4.44□□□□□ -1.7
NEJ1Q06148 MTC2YKL098W 1074 nt4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.3 ms